RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.14□□□□□ -0.95
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PRDM16-201ENST00000270722 AKAP13Q12802 2813 aa9.12□□□□□ -0.95
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PRDM16-201ENST00000270722 Q5VV11 94 aa8.73□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 OCR1Q9BZK8 76 aa8.73□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.73□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 PRR34Q9NV39 138 aa8.73□□□□□ -1.01
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PRDM16-201ENST00000270722 HRES1P13985 223 aa8.72□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 KLK9Q2XQG4 91 aa8.72□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 A0A1B0GU33 70 aa8.71□□□□□ -1.01
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PRDM16-201ENST00000270722 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
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PRDM16-201ENST00000270722 K7EIL1 84 aa8.71□□□□□ -1.01
PRDM16-201ENST00000270722 C15orf56Q8N910 161 aa8.71□□□□□ -1.02
PRDM16-201ENST00000270722 M0R2T5 61 aa8.7□□□□□ -1.02
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PRDM16-201ENST00000270722 IGFL1Q6UW32 110 aa8.7□□□□□ -1.02
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PRDM16-201ENST00000270722 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRDM16-201ENST00000270722 CHD6Q8TD26 2715 aa8.66□□□□□ -1.02
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PRDM16-201ENST00000270722 ROMO1P60602 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 SPRR4Q96PI1 79 aa8.63□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 TNP2Q05952 138 aa8.63□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.62□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF575Q86XF7 245 aa8.62□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.61□□□□□ -1.03
PRDM16-201ENST00000270722 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRDM16-201ENST00000270722 A0A087X002 238 aa8.55□□□□□ -1.04
PRDM16-201ENST00000270722 Q8N377 158 aa8.55□□□□□ -1.04
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.55□□□□□ -1.04
PRDM16-201ENST00000270722 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.53□□□□□ -1.04
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP10-11P60412 298 aa8.52□□□□□ -1.04
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