RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CHTF8P0CG12 524 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 VPREB1P12018 145 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 FABP2P12104 132 aa6.69□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 K7EP34 96 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRIAP1O43715 76 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 VAMP3Q15836 100 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 H7C2G1 150 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 UBE2V1Q13404 147 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2EQ4V326 116 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 IGLV6-57P01721 117 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TMEM126AQ9H061 195 aa6.66□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 GAGE10A6NGK3 116 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 NCR3O14931 201 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 Q1RN00 199 aa6.65□□□□□ -1.34
APOC3-201ENST00000227667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 A0A096LNI7 61 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 TCL1BO95988 128 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PSMB2P49721 201 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PRR4Q16378 134 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.64□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 M0R378 163 aa6.63□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.63□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 FAM168BA1KXE4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 COX6CP09669 75 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PRO0461Q9UI25 63 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 H3BMG7 143 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LST1O00453 97 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 A0A1W2PNN7 141 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 C22orf24Q9Y442 160 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 H0YGX0 51 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 ATXN8Q156A1 80 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 CLEC2BQ92478 149 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC3-201ENST00000227667 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 C6orf99Q4VX62 202 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 F8W1H4 67 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 TRACP01848 142 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00167Q96N53 147 aa6.57□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 SPRR1AP35321 89 aa6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.56□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GX51 115 aa6.55□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 M0QXV9 152 aa6.55□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 PRYO14603 147 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 LINC00575Q6W349 94 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 DIRC1Q969H9 104 aa6.54□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 C9JAW5 83 aa6.53□□□□□ -1.36
APOC3-201ENST00000227667 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 SLC25A20O43772 301 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 MTURNQ8N3F0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 H3BT86 120 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 COX7BP24311 80 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.51□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 B5MCH6 92 aa6.49□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 hADV29S1A0JD25 119 aa6.48□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZRX8 168 aa6.48□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 MUC17Q685J3 4493 aa6.47□□□□□ -1.37
APOC3-201ENST00000227667 ETDBQ3ZM63 59 aa6.47□□□□□ -1.37
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