RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637434.1

SPTAN1-235, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 1,496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-235ENST00000637434 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.57□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 GAGE10A6NGK3 116 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 J3QQQ9 107 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 S100A2P29034 98 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 C22orf24Q9Y442 160 aa7.56□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 SMIM6P0DI80 62 aa7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 C1orf137Q5JT78 98 aa7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 Q8NDZ9 215 aa7.55□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 MYCBP2O75592 4640 aa7.54□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 AKR1D1P51857 326 aa7.54□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 SFTA2Q6UW10 78 aa7.54□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 DAND5Q8N907 189 aa7.54□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.54□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.53□□□□□ -1.2
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SPTAN1-235ENST00000637434 E9PLD3 99 aa7.53□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.53□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 C12orf57Q99622 126 aa7.53□□□□□ -1.2
SPTAN1-235ENST00000637434 C20orf202A1L168 122 aa7.52□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 HERV-K104P63124 156 aa7.52□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 COX17Q14061 63 aa7.52□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.52□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC00167Q96N53 147 aa7.51□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.51□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 VPREB1P12018 145 aa7.5□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 NPC2P61916 151 aa7.5□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 S100A12P80511 92 aa7.5□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.5□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 IGKV2D-28P01615 120 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A0J9YXY3 114 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 NMUP48645 174 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.49□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 ZNF815PA8K554 130 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 J3QL48 77 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 NCR3O14931 201 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV7-43P04211 117 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.48□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SPTAN1-235ENST00000637434 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.47□□□□□ -1.21
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SPTAN1-235ENST00000637434 PYY3Q5JQD4 70 aa7.44□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 PCP2Q8IVA1 136 aa7.44□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.43□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.43□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 M0R378 163 aa7.42□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.42□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 UBE2AP49459 152 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 PRLHP81277 87 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 DIRC1Q969H9 104 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-235ENST00000637434 TMEM126AQ9H061 195 aa7.4□□□□□ -1.22
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SPTAN1-235ENST00000637434 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 REG3GQ6UW15 175 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-235ENST00000637434 MT1HL1P0DM35 61 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 TIMM17BO60830 172 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 DDTP30046 118 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC01600Q96MT4 127 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 RNF213Q63HN8 5207 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-235ENST00000637434 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 PRYO14603 147 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 NDUFC2O95298 119 aa7.33□□□□□ -1.24
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