RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	ATP5L	O75964	103 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	NDUFA6	P56556	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	PMVK	Q15126	192 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00310	P59036	64 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505		H3BRM9	83 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	VPREB1	P12018	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM218	A2RU14	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505		Q8NDZ9	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505		M0R378	163 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	S100P	P25815	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	NDUFA5	Q16718	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505		A0A0U1RRA0	63 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505	SEC11C	Q9BY50	192 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-222	ENST00000620505		A0A096LNJ9	63 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00158	P58513	81 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	APOC3	P02656	99 aa		5	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	DAND5	Q8N907	189 aa		5	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	NCR3	O14931	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	HBD	P02042	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00614	P0C842	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	COX17	Q14061	63 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	COX19	Q49B96	90 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SVBP	Q8N300	66 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SNAPIN	O95295	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	RHEB	Q15382	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505		Q8NBF4	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-222	ENST00000620505	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	PRY	O14603	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CTAG1A	P78358	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	S100A1	P23297	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	SPRR1A	P35321	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MOBP	Q13875	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505		H0Y8G0	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505		B5MCH6	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	SPINK1	P00995	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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