RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE2BQ13066 116 aa6.95□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.95□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 OXTP01178 125 aa6.94□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 HERVK_113P63121 156 aa6.94□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.94□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 B5MCH6 92 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 ATP5LO75964 103 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA0087Q14695 138 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C1orf195Q5TG92 126 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.93□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 A0A0J9YXV3 536 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 COLCA2A8K830 154 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C10orf25Q5T742 122 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.92□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 PRSS2P07478 247 aa6.91□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C4orf26Q17RF5 130 aa6.91□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.91□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.91□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 A0A1W2PNN7 141 aa6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 Q8IZM0 81 aa6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.9□□□□□ -1.3
UBXN8-209ENST00000620074 C2orf82Q6UX34 121 aa6.89□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 Q6ZRP5 223 aa6.89□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.89□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.88□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 HSD52Q0P140 79 aa6.88□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 YPEL4Q96NS1 127 aa6.88□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 A0A096LNJ9 63 aa6.87□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 HBDP02042 147 aa6.87□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 CXCL5P42830 114 aa6.87□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.87□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 F8VRH5 84 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE2EQ4V326 116 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 FAM168BA1KXE4 195 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 H3BRM9 83 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 IGLC3P0DOY3 106 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 COX7B2Q8TF08 81 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN8-209ENST00000620074 H3BS24 57 aa6.83□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFA6P56556 154 aa6.83□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 PMCHL1Q16048 86 aa6.83□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.83□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 SPINK8P0C7L1 97 aa6.82□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 C9JAW5 83 aa6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 MT1HL1P0DM35 61 aa6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 REG3GQ6UW15 175 aa6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 TNXBP22105 4242 aa6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFC2O95298 119 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 C1orf137Q5JT78 98 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2BP63146 152 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 BATFQ16520 125 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 BAGE3Q86Y29 109 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 LINC01600Q96MT4 127 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 C11orf86A6NJI1 115 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN8-209ENST00000620074 TRGC2P03986 189 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV7-43P04211 117 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 FABP4P15090 132 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 SFTA2Q6UW10 78 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 C22orf24Q9Y442 160 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.76□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 A0A0U1RQV1 116 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 DIRC1Q969H9 104 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.75□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 NUPR1O60356 82 aa6.74□□□□□ -1.33
UBXN8-209ENST00000620074 COX17Q14061 63 aa6.74□□□□□ -1.33
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