RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZQY7	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2B	P63146	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	PRY	O14603	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428		A0A096LPF7	62 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428		A0A0J9YWU9	116 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ACACA-231	ENST00000614428	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	EDN2	P20800	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	SLPI	P03973	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428		Q8N3U1	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	VWF	P04275	2813 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZQT0	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	DMD	P11532	3685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428		A0A096LNT2	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZVQ6	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	PRM2	P04554	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACACA-231	ENST00000614428		H3BPC8	53 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428		A0A087WVE0	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	ESRG	Q1W209	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB4A	O15263	64 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2A	P49459	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZRX8	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	LAMA5	O15230	3695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428		X6R8D5	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428		Q9UF83	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	PRB1	P04280	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-231	ENST00000614428	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms