RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588730.1

C18orf25-202, Transcript of chromosome 18 open reading frame 25, humanhuman

TSL 5

Gene C18orf25, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf25-202ENST00000588730 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 HERV-K104P63124 156 aa7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 Q8NDZ9 215 aa7.6□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.59□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 LINC00167Q96N53 147 aa7.59□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.59□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.59□□□□□ -1.19
C18orf25-202ENST00000588730 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 OXTP01178 125 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 IGLV7-43P04211 117 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 VPREB1P12018 145 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.58□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 E9PLD3 99 aa7.57□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 ATOH7Q8N100 152 aa7.57□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.57□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 DAND5Q8N907 189 aa7.57□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.56□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 IGKV2D-28P01615 120 aa7.56□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 S100A6P06703 90 aa7.56□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 S100A2P29034 98 aa7.56□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 C20orf202A1L168 122 aa7.55□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 NMUP48645 174 aa7.55□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.55□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.55□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.54□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 LINC00587B1AMM8 73 aa7.54□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.54□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 A0A0J9YXY3 114 aa7.53□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 NCR3O14931 201 aa7.53□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 REG3GQ6UW15 175 aa7.53□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C18orf25-202ENST00000588730 MT1HL1P0DM35 61 aa7.52□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 NPC2P61916 151 aa7.52□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 DIRC1Q969H9 104 aa7.52□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 ZNF815PA8K554 130 aa7.51□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 TMEM238C9JI98 176 aa7.51□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 H0Y9J4 135 aa7.51□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 BCE1O60756 84 aa7.51□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.51□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.5□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.5□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.5□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 M0R378 163 aa7.49□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 ZNF861PO60384 105 aa7.49□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 LINC01600Q96MT4 127 aa7.49□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.49□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 UBE2AP49459 152 aa7.48□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.48□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 TMEM126AQ9H061 195 aa7.48□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 C5orf52A6NGY3 159 aa7.47□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 PRLHP81277 87 aa7.47□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 LITAFQ99732 161 aa7.47□□□□□ -1.21
C18orf25-202ENST00000588730 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.46□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 PCP2Q8IVA1 136 aa7.46□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.45□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.45□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.45□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.45□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.45□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 TIMM17BO60830 172 aa7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 AKR1D1P51857 326 aa7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 HERC1Q15751 4861 aa7.44□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 PRYO14603 147 aa7.43□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 SCGB1D1O95968 90 aa7.43□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 KRTAP10-8P60410 259 aa7.43□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.43□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 DDTP30046 118 aa7.42□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 NDUFC2O95298 119 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.41□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.4□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C18orf25-202ENST00000588730 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.39□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.39□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 SPANXCQ9NY87 97 aa7.39□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 IGLV6-57P01721 117 aa7.38□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 SPRR1AP35321 89 aa7.38□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 S100A12P80511 92 aa7.38□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 TNXBP22105 4242 aa7.37□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.37□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.37□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.36□□□□□ -1.23
C18orf25-202ENST00000588730 A0A087X002 238 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms