RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.85□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.85□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 LINC00158P58513 81 aa7.85□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.85□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GV90 55 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 RNF151Q2KHN1 245 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 Q9HAA7 133 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.84□□□□□ -1.15
GGA3-217ENST00000583667 RNF213Q63HN8 5207 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 Q5VSD8 79 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 C6orf223Q8N319 242 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 DAND5Q8N907 189 aa7.83□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 K7ERJ3 54 aa7.82□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 C10orf25Q5T742 122 aa7.82□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 A0A0U1RRA0 63 aa7.81□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 NDUFC2O95298 119 aa7.81□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 PFN2P35080 140 aa7.81□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.81□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.81□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 USP17L23D6RBM5 183 aa7.8□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 RAB37Q96AX2 223 aa7.8□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PPM0 123 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 H3BUT2 72 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 SYCNQ0VAF6 134 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.79□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN13O95857 204 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZRU5 148 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-217ENST00000583667 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 FABP2P12104 132 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 XGP55808 180 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-2P60368 255 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 NPC2P61916 151 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2D-28P01615 120 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 SLPIP03973 132 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 C14orf177Q52M58 125 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 UBE2V1Q13404 147 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 VAMP3Q15836 100 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 CARD19Q96LW7 228 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 K7EP34 96 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 PSCAO43653 123 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 GAGE10A6NGK3 116 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
GGA3-217ENST00000583667 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 WFDC2Q14508 124 aa7.71□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.71□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 COX6CP09669 75 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZRP5 223 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 TMEM126AQ9H061 195 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 TRIAP1O43715 76 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 PSMB2P49721 201 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 Q1RN00 199 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 Q8NDZ9 215 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 FAM229AH3BQW9 127 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 H7C2G1 150 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 LECT2O14960 151 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 IGLV6-57P01721 117 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 VPREB1P12018 145 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.66□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.66□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WTM6 91 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 H0YGX0 51 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 M0R378 163 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 TCL1BO95988 128 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 Q8N814 137 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 LINC01600Q96MT4 127 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-217ENST00000583667 GAGE2EQ4V326 116 aa7.64□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms