RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932		F8VRH5	84 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADIRF	Q15847	76 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPINK1	P00995	79 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	NAT8	Q9UHE5	227 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	CXCL5	P42830	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	HERVK_113	P63121	156 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRLH	P81277	87 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	VCX2	Q9H322	139 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TOM1L1-223	ENST00000576932		C9JQL5	133 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEC11A	P67812	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q8N8P6	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		M0R2T5	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SSPO	A2VEC9	5147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		K7EMI3	77 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q8NBF4	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	USH2A	O75445	5202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCO1	O75880	301 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC25A20	O43772	301 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q8N377	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		M0R378	163 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB5B	P61020	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	IFITM2	Q01629	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	PEA15	Q15121	130 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	G0S2	P27469	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERAS	Q7Z444	233 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q8NDZ9	215 aa		5	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP5L	O75964	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	PFN2	P35080	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	LITAF	Q99732	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CFC1	P0CG37	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932		H3BRM9	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	COX17	Q14061	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB14	P61106	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	PMVK	Q15126	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	MOBP	Q13875	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPRR1A	P35321	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms