RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560538.1

GATM-211, Transcript of glycine amidinotransferase, humanhuman

TSL 3

Gene GATM, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATM-211ENST00000560538 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.63□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 RYR1P21817 5038 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 A0A087WYN8 130 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 TMEM223A0PJW6 202 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 CHTF8P0CG12 524 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 HERV-K104P63124 156 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 COX17Q14061 63 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.62□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 HAMPP81172 84 aa5.61□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.61□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 LEPROTO15243 131 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 VPREB1P12018 145 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 NMUP48645 174 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 LINC00158P58513 81 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 Q5VSD8 79 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 Q6ZRP5 223 aa5.6□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 C3orf79P0CE67 100 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 PFN2P35080 140 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 ERG28Q9UKR5 140 aa5.59□□□□□ -1.51
GATM-211ENST00000560538 HERC2O95714 4834 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 J3QQQ9 107 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 UBE2BP63146 152 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 UBE2V1Q13404 147 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 LINC01545Q5VT33 79 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 PANO1I0J062 215 aa5.57□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.57□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 HSPG2P98160 4391 aa5.57□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.56□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.56□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 E9PLD3 99 aa5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 M0QXV9 152 aa5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 S100A12P80511 92 aa5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 A0A0U1RRA0 63 aa5.54□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 A0A1W2PNN7 141 aa5.54□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 COPS9Q8WXC6 57 aa5.54□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.54□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 SMIM13P0DJ93 91 aa5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 Q75L30 129 aa5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 C22orf24Q9Y442 160 aa5.53□□□□□ -1.52
GATM-211ENST00000560538 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 FAM168BA1KXE4 195 aa5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 C5orf52A6NGY3 159 aa5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 ZNF815PA8K554 130 aa5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 C1orf137Q5JT78 98 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.51□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 IGKV2-30P06310 120 aa5.5□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 ATOH7Q8N100 152 aa5.5□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 FAT1Q14517 4588 aa5.5□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 A0A0J9YXY3 114 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 TMEM238C9JI98 176 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 M0R378 163 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 TIMM17BO60830 172 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.49□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.48□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 REG3GQ6UW15 175 aa5.48□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.48□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.47□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 Q6ZVH6 145 aa5.47□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 DIRC1Q969H9 104 aa5.47□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 LINC00167Q96N53 147 aa5.47□□□□□ -1.53
GATM-211ENST00000560538 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.46□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 UBE2AP49459 152 aa5.46□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 DAND5Q8N907 189 aa5.46□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.45□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.45□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 NDUFC2O95298 119 aa5.45□□□□□ -1.54
GATM-211ENST00000560538 IGKV2D-28P01615 120 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms