RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	ESRG	Q1W209	222 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667		Q8N814	137 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.71	□□□□□ -1.49
RBM23-233	ENST00000557667	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667		K7EIL1	84 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667		Q6JHZ5	121 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	LECT2	O14960	151 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	CCK	P06307	115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	NCR3	O14931	201 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	STAB1	Q9NY15	2570 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBM23-233	ENST00000557667		F8WEM9	126 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	ATOX1	O00244	68 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZRU5	148 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	RELN	P78509	3460 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	C16orf90	A8MZG2	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667		H0Y9J4	135 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667		J3KT08	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2B	P63146	152 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	ATM	Q13315	3056 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	CD164	Q04900	197 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667		A0A087WYN8	130 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	OXT	P01178	125 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.61	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	CXCL6	P80162	114 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	PDZD2	O15018	2839 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RBM23-233	ENST00000557667	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.59	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.59	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.59	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.59	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	SPRR1A	P35321	89 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	UQCRQ	O14949	82 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZRX8	168 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	APC	P25054	2843 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RBM23-233	ENST00000557667	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.56	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms