RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 C9orf118A6NHY6 69 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 F8WDY8 70 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 APLNQ9ULZ1 77 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 HIGD1BQ9P298 99 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.41□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 DLEU1O43261 78 aa5.41□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 WIPF1O43516 503 aa5.41□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 AMELXQ99217 191 aa5.41□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 A8MTW9 85 aa5.41□□□□□ -1.54
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SENP1-210ENST00000552189 TRIAP1O43715 76 aa5.31□□□□□ -1.56
SENP1-210ENST00000552189 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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SENP1-210ENST00000552189 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.3□□□□□ -1.56
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SENP1-210ENST00000552189 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.29□□□□□ -1.56
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SENP1-210ENST00000552189 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SENP1-210ENST00000552189 LINC00310P59036 64 aa5.28□□□□□ -1.56
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SENP1-210ENST00000552189 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.27□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 PRR4Q16378 134 aa5.27□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 RELNP78509 3460 aa5.27□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.27□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 MOBPQ13875 183 aa5.26□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 SCXQ7RTU7 201 aa5.26□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 LIMD2Q9BT23 127 aa5.26□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 MP68P56378 58 aa5.25□□□□□ -1.57
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