RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BBP33778 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 PFN2P35080 140 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BDP58876 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BCP62807 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HSBP1O75506 76 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 GAGE10A6NGK3 116 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 SERF1AO75920 110 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 LINC00310P59036 64 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 PRR4Q16378 134 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 MUC17Q685J3 4493 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 S100A6P06703 90 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 HERV-K104P63124 156 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 Q8NDZ9 215 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 TMEM126AQ9H061 195 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 A0A087X002 238 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 LEPROTL1O95214 131 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 IGKV2D-28P01615 120 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 CRYGAP11844 174 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 UBE2AP49459 152 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 LINC00158P58513 81 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 LINC00587B1AMM8 73 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 M0R378 163 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-221ENST00000550734 PLNP26678 52 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 TMEM238C9JI98 176 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 SMIM13P0DJ93 91 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 LEPROTO15243 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 FABP4P15090 132 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 S100A2P29034 98 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RRA0 63 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 DPM2O94777 84 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 CTAG1AP78358 180 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 PRLHP81277 87 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 SPRR1AP35321 89 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 H0Y8G0 127 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 J3QQQ9 107 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 PRYO14603 147 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 NMUP48645 174 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-221ENST00000550734 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 IGKCP01834 107 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 HERVK_113P61574 105 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 TSPAN13O95857 204 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 C5orf52A6NGY3 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 KRTDAPP60985 99 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 E9PLD3 99 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 NCR3O14931 201 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 NDUFC2O95298 119 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 SPRR4Q96PI1 79 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 C3orf79P0CE67 100 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 S100A12P80511 92 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 DAND5Q8N907 189 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 C20orf202A1L168 122 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 LINC01545Q5VT33 79 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 PET117Q6UWS5 81 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-221ENST00000550734 A0A0J9YXY3 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-221ENST00000550734 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-221ENST00000550734 B5MCH6 92 aa6.64□□□□□ -1.35
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