RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545419.5

RNF10-223, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 5

Gene RNF10, Length 1,336 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-223	ENST00000545419		A0A096LNI7	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		A0A0J9YXV3	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		H3BRM9	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	HERVK_113	P63121	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	STPG4	Q8N801	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	NDUFA1	O15239	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	NMU	P48645	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		A0A0A0MQY5	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		A0A1W2PNN7	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		E9PLD3	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	COX8A	P10176	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	CTAG1A	P78358	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	LEPROT	O15243	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	DLEU1	O43261	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	DDT	P30046	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		Q8IZM0	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	OXT	P01178	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	PRSS2	P07478	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419		Q6ZRP5	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF10-223	ENST00000545419	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419		J3QQQ9	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	CXCL5	P42830	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419		M0R143	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	HERV-K104	P63124	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	TAL2	Q16559	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	HSD52	Q0P140	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	COX17	Q14061	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF10-223	ENST00000545419	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419		Q6ZVH6	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF10-223	ENST00000545419	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms