RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	LITAF	Q99732	161 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DDB1-223	ENST00000543658	CTAG1A	P78358	180 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	PKD1	P98161	4303 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	TAL2	Q16559	108 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WYN8	130 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	HSD52	Q0P140	79 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZSA8	131 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	PANO1	I0J062	215 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658		M0QXV9	152 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	LCE2B	O14633	110 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	NCR3	O14931	201 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFC2	O95298	119 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PNN7	141 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	VPREB1	P12018	145 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2B	P63146	152 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658		M0R378	163 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	CEND1	Q8N111	149 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	HAMP	P81172	84 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658		A4D1N5	150 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	GAGE10	A6NGK3	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658		M0R143	59 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	DDT	P30046	118 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	CDK2AP2	O75956	126 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658		Q8NDZ9	215 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	PKHD1	P08F94	4074 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658		A6NDN8	102 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDB1-223	ENST00000543658	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	EPM2A	B3EWF7	344 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	FXYD2	P54710	66 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	XG	P55808	180 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM126A	Q9H061	195 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0B4J2C4	111 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	PRY	O14603	147 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	BATF	Q16520	125 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	CFC1	P0CG37	223 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658		Q1RN00	199 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		7.42	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.42	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658		H7C2G1	150 aa		7.41	□□□□□ -1.22

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