RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087X002	238 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDX11-222	ENST00000542777	SPINK8	P0C7L1	97 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDX11-222	ENST00000542777	CRYGA	P11844	174 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE10	A6NGK3	116 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	MUC2	Q02817	5179 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	C3orf79	P0CE67	100 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2A	P49459	152 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0U1RQV1	116 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM223	A0PJW6	202 aa		9.39	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		9.39	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777		H3BRM9	83 aa		9.38	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		9.38	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		9.37	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	DPM2	O94777	84 aa		9.37	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2D-28	P01615	120 aa		9.37	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	KRTDAP	P60985	99 aa		9.37	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01545	Q5VT33	79 aa		9.37	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf52	A6NGY3	159 aa		9.36	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	PFN2	P35080	140 aa		9.36	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		9.36	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		9.36	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	IGKC	P01834	107 aa		9.35	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	S100A6	P06703	90 aa		9.35	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	PET117	Q6UWS5	81 aa		9.35	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		9.35	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		9.34	□□□□□ -0.91
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		9.33	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	PLN	P26678	52 aa		9.33	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	PRLH	P81277	87 aa		9.33	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		9.33	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	VPREB1	P12018	145 aa		9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	S100A2	P29034	98 aa		9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM126A	Q9H061	195 aa		9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM238	C9JI98	176 aa		9.31	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	ERG28	Q9UKR5	140 aa		9.31	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	ATOH7	Q8N100	152 aa		9.3	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	COX17	Q14061	63 aa		9.29	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777		M0R378	163 aa		9.28	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	LEPROT	O15243	131 aa		9.28	□□□□□ -0.92
DDX11-222	ENST00000542777	CTAG1A	P78358	180 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	CDIP1	Q9H305	208 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777		J3QQQ9	107 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	TPRXL	Q17RH7	258 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777		Q8NDZ9	215 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777		E9PLD3	99 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	MUC17	Q685J3	4493 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	HERVK_113	P61574	105 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	SFTA2	Q6UW10	78 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0U1RRA0	63 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf202	A1L168	122 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM13	P0DJ93	91 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00158	P58513	81 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		9.2	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		9.2	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		9.19	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	SPRR4	Q96PI1	79 aa		9.19	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		9.18	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	DAND5	Q8N907	189 aa		9.18	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0J9YXY3	114 aa		9.17	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	SCGB1D1	O95968	90 aa		9.17	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	HERV-K104	P63124	156 aa		9.17	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		9.17	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	PCP2	Q8IVA1	136 aa		9.17	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	NMU	P48645	174 aa		9.16	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		9.16	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	9.15	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		9.15	□□□□□ -0.94
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF815P	A8K554	130 aa		9.14	□□□□□ -0.95
DDX11-222	ENST00000542777	PRY	O14603	147 aa		9.14	□□□□□ -0.95
DDX11-222	ENST00000542777	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		9.14	□□□□□ -0.95

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