RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526207.1

TXNRD1-210, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNRD1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-210ENST00000526207 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC00167Q96N53 147 aa4.01□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.01□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 C1orf195Q5TG92 126 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 COMMD7Q86VX2 200 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 AMN1Q8IY45 258 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 NRACQ8N912 160 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 S100ZQ8WXG8 99 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 TIMM21Q9BVV7 248 aa4□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 IFITM10A6NMD0 228 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF727A8MUV8 499 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 M0R143 59 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 PRLHP81277 87 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 IFITM2Q01629 132 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 BATFQ16520 125 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 C4orf26Q17RF5 130 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 LCE1EQ5T753 118 aa3.99□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 A0A1B0GX51 115 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 SCO1O75880 301 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 UBE2AP49459 152 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 RIGQ13278 110 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 MANBALQ9NQG1 85 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 MED9Q9NWA0 146 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.98□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC00862A6NCI5 91 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 UMAD1C9J7I0 102 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 HBBP68871 147 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 DAND5Q8N907 189 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.97□□□□□ -1.77
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC01551Q86U37 167 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 KIR2DL4Q99706 377 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.96□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.95□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 J3KT08 172 aa3.95□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 IGKV2D-28P01615 120 aa3.95□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.95□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 M0R2T5 61 aa3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 RHEBQ15382 184 aa3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8NBF4 154 aa3.94□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 A0A1B0GUT8 65 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 HIGD1CA8MV81 97 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 A8MWL6 223 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 PCOTHQ58A44 107 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 Q6ZVQ6 151 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 ERG28Q9UKR5 140 aa3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8IZM0 81 aa3.92□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 SPRR4Q96PI1 79 aa3.92□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.92□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM218A2RU14 115 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 NDUFC2O95298 119 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 PRSS2P07478 247 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF345Q14585 488 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8N377 158 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 CST9LQ9H4G1 147 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.91□□□□□ -1.78
TXNRD1-210ENST00000526207 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 F8VRH5 84 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 M0R378 163 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 NPYP01303 97 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 PFN2P35080 140 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 Q6ZN92 141 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 C20orf78Q9BR46 151 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.9□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 PPP1R17O96001 155 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 PMAIP1Q13794 54 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8NDZ9 215 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM141Q96I45 108 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.89□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.88□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 J3QR89 54 aa3.88□□□□□ -1.79
TXNRD1-210ENST00000526207 SPINK1P00995 79 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms