RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.82□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM141Q96I45 108 aa8.82□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.82□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.81□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00587B1AMM8 73 aa8.81□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.81□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 PRO1933Q9H354 126 aa8.81□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.81□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 IGLC3P0DOY3 106 aa8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZN92 141 aa8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.8□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 IGIPA6NJ69 53 aa8.79□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 NDUFA1O15239 70 aa8.79□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 PLNP26678 52 aa8.79□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.79□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 DPM2O94777 84 aa8.78□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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ALYREF-204ENST00000512673 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.78□□□□□ -1
ALYREF-204ENST00000512673 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.78□□□□□ -1
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ALYREF-204ENST00000512673 F8VRH5 84 aa8.77□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 IGKCP01834 107 aa8.77□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 ATOH7Q8N100 152 aa8.77□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.76□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 H0Y8G0 127 aa8.75□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 DLEU1O43261 78 aa8.75□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.75□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 PMVKQ15126 192 aa8.75□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.75□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.74□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 COX8AP10176 69 aa8.74□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.74□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 C14orf144Q96I85 54 aa8.74□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 BCE1O60756 84 aa8.73□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 C22orf24Q9Y442 160 aa8.73□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ALYREF-204ENST00000512673 M0R2T5 61 aa8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZUT4 128 aa8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 CST9LQ9H4G1 147 aa8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 USH2AO75445 5202 aa8.71□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.7□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.7□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.7□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.7□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.7□□□□□ -1.02
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ALYREF-204ENST00000512673 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.69□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 M0R143 59 aa8.69□□□□□ -1.02
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ALYREF-204ENST00000512673 C2orf82Q6UX34 121 aa8.69□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.69□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 C11orf86A6NJI1 115 aa8.68□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.68□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 F8WDY8 70 aa8.68□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 VCX2Q9H322 139 aa8.68□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 CTAG1AP78358 180 aa8.67□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.67□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.67□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 HIGD1BQ9P298 99 aa8.67□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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ALYREF-204ENST00000512673 E9PLD3 99 aa8.66□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 HERVK_113P61574 105 aa8.66□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.66□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FAM104AQ969W3 186 aa8.66□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA0087Q14695 138 aa8.65□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.65□□□□□ -1.02
ALYREF-204ENST00000512673 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.64□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 UBE2AP49459 152 aa8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SEC11AP67812 179 aa8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.63□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.62□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 GAGE10A6NGK3 116 aa8.62□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 NMUP48645 174 aa8.62□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.61□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM223A0PJW6 202 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 HSD52Q0P140 79 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 TAL2Q16559 108 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 XP32Q5T750 250 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 PCP2Q8IVA1 136 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00167Q96N53 147 aa8.6□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.59□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.59□□□□□ -1.03
ALYREF-204ENST00000512673 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.58□□□□□ -1.04
ALYREF-204ENST00000512673 LEPROTO15243 131 aa8.58□□□□□ -1.04
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