RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.5□□□□□ -1.21
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SFTA2Q6UW10 78 aa7.5□□□□□ -1.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.5□□□□□ -1.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 J3QQQ9 107 aa7.49□□□□□ -1.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.49□□□□□ -1.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.48□□□□□ -1.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.48□□□□□ -1.21
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATOH7Q8N100 152 aa7.48□□□□□ -1.21
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 COX17Q14061 63 aa7.46□□□□□ -1.22
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.46□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERG28Q9UKR5 140 aa7.46□□□□□ -1.22
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MT1HL1P0DM35 61 aa7.45□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBE2BP63146 152 aa7.44□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.44□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.44□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0J9YXY3 114 aa7.42□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PFN2P35080 140 aa7.42□□□□□ -1.22
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.42□□□□□ -1.22
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMIM13P0DJ93 91 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 REG3GQ6UW15 175 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCP2Q8IVA1 136 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LITAFQ99732 161 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C22orf24Q9Y442 160 aa7.41□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF815PA8K554 130 aa7.4□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGLV7-43P04211 117 aa7.4□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LINC01600Q96MT4 127 aa7.4□□□□□ -1.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.39□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 LINC00158P58513 81 aa7.39□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.39□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.39□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.39□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.38□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0U1RRA0 63 aa7.38□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 VPREB1P12018 145 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 XP32Q5T750 250 aa7.35□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 DAND5Q8N907 189 aa7.35□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.35□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 DLEU1O43261 78 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA45Q537H7 98 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.34□□□□□ -1.23
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRTAP10-8P60410 259 aa7.33□□□□□ -1.24
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM238C9JI98 176 aa7.31□□□□□ -1.24
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF861PO60384 105 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGKV2D-28P01615 120 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C14orf144Q96I85 54 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BCE1O60756 84 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NDUFC2O95298 119 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFITM1P13164 125 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPC2P61916 151 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.27□□□□□ -1.25
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