RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SCO1	O75880	301 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	AMELX	Q99217	191 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVG6	124 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM238	C9JI98	176 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM126A	Q9H061	195 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GXF2	115 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N8P6	123 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	DAND5	Q8N907	189 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	IGIP	A6NJ69	53 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5L	O75964	103 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PFN2	P35080	140 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8NBF4	154 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	G0S2	P27469	103 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R378	163 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK1	P00995	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK8	P0C7L1	97 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CFC1B	P0CG36	223 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR4	Q96PI1	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EMI3	77 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB14	P61106	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM17A	Q99595	171 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	VPREB1	P12018	145 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BRM9	83 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PEA15	Q15121	130 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM6	Q96B49	74 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511		C9JQL5	133 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		6	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2T5	61 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A20	O43772	301 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCYAP1	P18509	176 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1H	P80294	61 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MOBP	Q13875	183 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	COX17	Q14061	63 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PMVK	Q15126	192 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N377	158 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00158	P58513	81 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8NDZ9	215 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA6	P56556	154 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RRA0	63 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ND4L	P03901	98 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A12	P80511	92 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NCR3	O14931	201 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR1A	P35321	89 aa		5.88	□□□□□ -1.47

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