RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 COLCA2A8K830 154 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 FABP4P15090 132 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00158P58513 81 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 PRLHP81277 87 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM13P0DJ93 91 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 UBE2AP49459 152 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 LEPROTL1O95214 131 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 COX17Q14061 63 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 M0R378 163 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM126AQ9H061 195 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 NCR3O14931 201 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 TSPAN13O95857 204 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 SFTA2Q6UW10 78 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 DAND5Q8N907 189 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 LEPROTO15243 131 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 DPM2O94777 84 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 ATP6V1G1O75348 118 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 IGKCP01834 107 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 CRYGAP11844 174 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HERV-K104P63124 156 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 J3QQQ9 107 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BKO60814 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BJP06899 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BOP23527 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BBP33778 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BDP58876 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BCP62807 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 PRR4Q16378 134 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 PLNP26678 52 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-246ENST00000496569 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 HERVK_113P61574 105 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 NPC2P61916 151 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 PRYO14603 147 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 SPRR1AP35321 89 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 SPRR4Q96PI1 79 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 A0A0J9YXY3 114 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00587B1AMM8 73 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 E9PLD3 99 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-246ENST00000496569 DDTP30046 118 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 NMUP48645 174 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 ERC2-IT1O76042 136 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 C3orf79P0CE67 100 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 LINC01545Q5VT33 79 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 B5MCH6 92 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 KRTDAPP60985 99 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 LITAFQ99732 161 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 PET117Q6UWS5 81 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 Q9BRP9 147 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 MUC2Q02817 5179 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF815PA8K554 130 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV6-57P01721 117 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 ATOH7Q8N100 152 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFC2O95298 119 aa7.02□□□□□ -1.29
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