RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493957.5

UBA3-211, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBA3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3-211ENST00000493957 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 S100A1P23297 94 aa7.23□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.23□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.23□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBA3-211ENST00000493957 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 M0QXV9 152 aa7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 PFN2P35080 140 aa7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.2□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 ERG28Q9UKR5 140 aa7.19□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 DPM2O94777 84 aa7.18□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.18□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.17□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 IGKCP01834 107 aa7.17□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 PLNP26678 52 aa7.17□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 C22orf24Q9Y442 160 aa7.17□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 A0A0U1RRA0 63 aa7.16□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 C1orf137Q5JT78 98 aa7.16□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 Q8NDZ9 215 aa7.16□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.16□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 LEPROTO15243 131 aa7.15□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 C3orf79P0CE67 100 aa7.15□□□□□ -1.26
UBA3-211ENST00000493957 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 UBE2BP63146 152 aa7.14□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.14□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 GAGE10A6NGK3 116 aa7.13□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 LINC00158P58513 81 aa7.13□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 KRTDAPP60985 99 aa7.13□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 J3QQQ9 107 aa7.12□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 SFTA2Q6UW10 78 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 PET117Q6UWS5 81 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 LINC00167Q96N53 147 aa7.12□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 HERC1Q15751 4861 aa7.11□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 IGLV7-43P04211 117 aa7.11□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 HERVK_113P61574 105 aa7.11□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.11□□□□□ -1.27
UBA3-211ENST00000493957 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.11□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 OXTP01178 125 aa7.1□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 HERV-K104P63124 156 aa7.1□□□□□ -1.27
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UBA3-211ENST00000493957 ATOH7Q8N100 152 aa7.08□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.08□□□□□ -1.28
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UBA3-211ENST00000493957 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.07□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 IGKV2D-28P01615 120 aa7.07□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 NMUP48645 174 aa7.06□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.06□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 A0A0J9YXY3 114 aa7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 TMEM238C9JI98 176 aa7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 NCR3O14931 201 aa7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.05□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.05□□□□□ -1.28
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UBA3-211ENST00000493957 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.04□□□□□ -1.28
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UBA3-211ENST00000493957 NPC2P61916 151 aa7.04□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.04□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 LINC01600Q96MT4 127 aa7.04□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 C20orf202A1L168 122 aa7.03□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 H3BS24 57 aa7.03□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 REG3GQ6UW15 175 aa7.03□□□□□ -1.28
UBA3-211ENST00000493957 DIRC1Q969H9 104 aa7.03□□□□□ -1.28
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UBA3-211ENST00000493957 LINC00587B1AMM8 73 aa7.02□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 M0R378 163 aa7.02□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 ZNF861PO60384 105 aa7.02□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 LITAFQ99732 161 aa7.02□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.01□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 C5orf52A6NGY3 159 aa7.01□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.01□□□□□ -1.29
UBA3-211ENST00000493957 PRLHP81277 87 aa7.01□□□□□ -1.29
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