RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 IGKV2D-28P01615 120 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 C11orf86A6NJI1 115 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 LEPROTL1O95214 131 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 H0Y8G0 127 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 FABP4P15090 132 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA5-210ENST00000491036 ERG28Q9UKR5 140 aa9.48□□□□□ -0.89
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LAMA5-210ENST00000491036 PRLHP81277 87 aa9.46□□□□□ -0.9
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LAMA5-210ENST00000491036 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.46□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.46□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 COX17Q14061 63 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 TMEM238C9JI98 176 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 TMEM126AQ9H061 195 aa9.44□□□□□ -0.9
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LAMA5-210ENST00000491036 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 TMEM223A0PJW6 202 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00158P58513 81 aa9.41□□□□□ -0.9
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LAMA5-210ENST00000491036 M0R378 163 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA5-210ENST00000491036 Q8NDZ9 215 aa9.4□□□□□ -0.9
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LAMA5-210ENST00000491036 A0A0U1RRA0 63 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA5-210ENST00000491036 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA5-210ENST00000491036 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.37□□□□□ -0.91
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LAMA5-210ENST00000491036 A0A0U1RQV1 116 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA5-210ENST00000491036 IGKCP01834 107 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA5-210ENST00000491036 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.34□□□□□ -0.91
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LAMA5-210ENST00000491036 SMIM13P0DJ93 91 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.32□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 KRTDAPP60985 99 aa9.31□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 LINC01545Q5VT33 79 aa9.31□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 PET117Q6UWS5 81 aa9.31□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.31□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 NCR3O14931 201 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 LEPROTO15243 131 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 HERVK_113P61574 105 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 SPRR4Q96PI1 79 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 CDIP1Q9H305 208 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 MUC2Q02817 5179 aa9.3□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 PRYO14603 147 aa9.29□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 CTAG1AP78358 180 aa9.29□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.29□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.29□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 HERV-K104P63124 156 aa9.28□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LAMA5-210ENST00000491036 J3QQQ9 107 aa9.27□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 S100A6P06703 90 aa9.27□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 TPRXLQ17RH7 258 aa9.27□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.27□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00587B1AMM8 73 aa9.26□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.26□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.26□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.26□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.25□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.25□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 E9PLD3 99 aa9.25□□□□□ -0.93
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LAMA5-210ENST00000491036 S100A2P29034 98 aa9.25□□□□□ -0.93
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LAMA5-210ENST00000491036 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.24□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.24□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.23□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 SPRR1AP35321 89 aa9.23□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 DAND5Q8N907 189 aa9.23□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 C20orf202A1L168 122 aa9.22□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 S100A12P80511 92 aa9.22□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 ATOH7Q8N100 152 aa9.22□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 Q8NBF4 154 aa9.22□□□□□ -0.93
LAMA5-210ENST00000491036 NMUP48645 174 aa9.21□□□□□ -0.94
LAMA5-210ENST00000491036 MUC17Q685J3 4493 aa9.21□□□□□ -0.94
LAMA5-210ENST00000491036 C5orf52A6NGY3 159 aa9.2□□□□□ -0.94
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LAMA5-210ENST00000491036 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.19□□□□□ -0.94
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