RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 Q0VG73 95 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 MIAQ16674 131 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 Q8N8P6 123 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 K7EMI3 77 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 TAL2Q16559 108 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 RMI2Q96E14 147 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 IGIPA6NJ69 53 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 LECT2O14960 151 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 PSCAO43653 123 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 CRPP02741 224 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 IGFL1Q6UW32 110 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 Q6ZUT4 128 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 Q8N814 137 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGAP1-210ENST00000480054 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 A8MUU9 505 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 TRGC2P03986 189 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 LUZP6Q538Z0 58 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 TOMM6Q96B49 74 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 CCL25O15444 150 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00614P0C842 121 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 XCL1P47992 114 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 PSMB2P49721 201 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 FA2HQ7L5A8 372 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 TMEM141Q96I45 108 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 AMELXQ99217 191 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 C16orf90A8MZG2 172 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 NDUFS5O43920 106 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 S100A1P23297 94 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 G0S2P27469 103 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 KRTAP10-1P60331 282 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 SS18Q15532 418 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC01549A6NIU2 74 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 NUPR1O60356 82 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE2D1P51668 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 COX6A2Q02221 97 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 PMCHL1Q16048 86 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 CST9LQ9H4G1 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 PRO0628Q9UI54 55 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 COX7A2LO14548 114 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BKO60814 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HBDP02042 147 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BJP06899 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BOP23527 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BBP33778 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BDP58876 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 RAB5BP61020 215 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BCP62807 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 Q6ZSA8 131 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 C5orf38Q86SI9 138 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 BAGE3Q86Y29 109 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 PMVKQ15126 192 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGAP1-210ENST00000480054 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 322.2 ms