RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463927.6

TIMMDC1-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene TIMMDC1, Length 670 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-202ENST00000463927 HERV-K104P63124 156 aa6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.14□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 FABP4P15090 132 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 PFN2P35080 140 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 CTAG1AP78358 180 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 SVIPQ8NHG7 77 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 C22orf24Q9Y442 160 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGKCP01834 107 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGLV7-43P04211 117 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 DIRC1Q969H9 104 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 NMUP48645 174 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 LEPROTO15243 131 aa6.1□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 LINC00158P58513 81 aa6.1□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.439e-7■■□□□ 12.4
TIMMDC1-202ENST00000463927 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1-202ENST00000463927 H0Y9J4 135 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 J3QQQ9 107 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 AKR1D1P51857 326 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 PET117Q6UWS5 81 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 LINC01600Q96MT4 127 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 C20orf202A1L168 122 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 BCE1O60756 84 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 VPREB1P12018 145 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 LINC00167Q96N53 147 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 E9PLD3 99 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF861PO60384 105 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 SMIM13P0DJ93 91 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 LINC01545Q5VT33 79 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 GAGE10A6NGK3 116 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 MT1HL1P0DM35 61 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 A0A0U1RRA0 63 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGKV2D-28P01615 120 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 S100A12P80511 92 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 M0R378 163 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 C3orf79P0CE67 100 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 UBE2AP49459 152 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTDAPP60985 99 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-202ENST00000463927 S100A2P29034 98 aa6.02□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRYO14603 147 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 S100A6P06703 90 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM126AQ9H061 195 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 A0A0J9YXY3 114 aa6□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 TIMM17BO60830 172 aa6□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF815PA8K554 130 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 NCR3O14931 201 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 NDUFC2O95298 119 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTAP10-8P60410 259 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 Q8NDZ9 215 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 DAND5Q8N907 189 aa5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 COPS9Q8WXC6 57 aa5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM238C9JI98 176 aa5.97□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRLHP81277 87 aa5.97□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.97□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 TNXBP22105 4242 aa5.97□□□□□ -1.45
TIMMDC1-202ENST00000463927 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-202ENST00000463927 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms