RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ERG28Q9UKR5 140 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 LINC00587B1AMM8 73 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 TIMM17BO60830 172 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 SMIM13P0DJ93 91 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PFN2P35080 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 COX17Q14061 63 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 A0A0U1RRA0 63 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 TSTD3H0UI37 97 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PANO1I0J062 215 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 LINC00158P58513 81 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 TMEM238C9JI98 176 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 LITAFQ99732 161 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 HIGD1BQ9P298 99 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZRP5 223 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 DAND5Q8N907 189 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SPANXCQ9NY87 97 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 CHTF8P0CG12 524 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 GAGE2EQ4V326 116 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZVH6 145 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 DPH3Q96FX2 82 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 GAGE2BQ13066 116 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H4GQ99525 98 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 A0A096LNI7 61 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 PTTG1IPP53801 180 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 NPC2P61916 151 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 COPS9Q8WXC6 57 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 MT1HL1P0DM35 61 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 IFITM1P13164 125 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 TAL2Q16559 108 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-208ENST00000438888 DDTP30046 118 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 HSD52Q0P140 79 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WYN8 130 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 CTAG1AP78358 180 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 CEND1Q8N111 149 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 C7orf33Q8WU49 177 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 FAM168BA1KXE4 195 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-208ENST00000438888 A4D1N5 150 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 M0R143 59 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 NDUFC2O95298 119 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 VPREB1P12018 145 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 Q8NDZ9 215 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 A6NJY4 79 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 FXYD2P54710 66 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PNN7 141 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 TNXBP22105 4242 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 NCR3O14931 201 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 M0QXV9 152 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2D-28P01615 120 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 C22orf24Q9Y442 160 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 M0R378 163 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PRAME-208ENST00000438888 A0A0B4J2C4 111 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 CFC1BP0CG36 223 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 CFC1P0CG37 223 aa7.71□□□□□ -1.18
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