RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420367.1

PDCD4-AS1-201, PDCD4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDCD4-AS1, Length 778 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 AMELXQ99217 191 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.82□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 HBDP02042 147 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 C3orf79P0CE67 100 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PMCHL1Q16048 86 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.81□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC01546A6NGU7 62 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 UBE2AP49459 152 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PET117Q6UWS5 81 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC01549A6NIU2 74 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC00167Q96N53 147 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 VAMP8Q9BV40 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.78□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.78□□□□□ -1.32
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGIPA6NJ69 53 aa6.77□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.77□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ATP5LO75964 103 aa6.77□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.77□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.77□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TIMM17AQ99595 171 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PRO1933Q9H354 126 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 GAGE10A6NGK3 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 H0Y8G0 127 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SPATA45Q537H7 98 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC01545Q5VT33 79 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 COX7B2Q8TF08 81 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 A0A096LNJ9 63 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 DDTP30046 118 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TOMM6Q96B49 74 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ERASQ7Z444 233 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ATOH7Q8N100 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LINC00587B1AMM8 73 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGKV2D-28P01615 120 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 H3BRM9 83 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 DPM2O94777 84 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TMEM126AQ9H061 195 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGLC3P0DOY3 106 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PRLHP81277 87 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 COX17Q14061 63 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 IGKCP01834 107 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PLNP26678 52 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SFTA2Q6UW10 78 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 MUC17Q685J3 4493 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 M0R378 163 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 VPREB1P12018 145 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PFN2P35080 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PMVKQ15126 192 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 C14orf144Q96I85 54 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CST9LQ9H4G1 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TMEM238C9JI98 176 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 M0R143 59 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SPINK1P00995 79 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SPINK8P0C7L1 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 COX8AP10176 69 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ERG28Q9UKR5 140 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 HERVK_113P61574 105 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms