RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8WEM9 126 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSLPQ969D9 159 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPTSSAQ969W0 71 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPH3Q96FX2 82 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC172P0C7W6 258 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNGT1P63211 74 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAR1AQ9NR31 198 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED31Q9Y3C7 131 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0Y9P7 68 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf16Q9BUW7 83 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRIN2AQ12879 1464 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GX51 115 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BQF6 201 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100PP25815 95 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 WT1-ASQ06250 92 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 BANF2Q9H503 90 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALML5Q9NZT1 146 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP3K5Q99683 1374 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP53Q96M91 514 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCR10Q9UDW1 63 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 SS18L2Q9UHA2 77 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM9CQ8IZT9 166 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYDC1Q8WWB3 177 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC400499M0QZD8 3231 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATG12O94817 140 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP4S1Q9Y587 144 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX14Q8IWB6 1497 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN7AQ01118 1682 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF20BQ96Q89 1820 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 A2ML1A8K2U0 1454 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAEPP09466 180 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM21Q3B7S5 101 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM24BQ8N5W8 94 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP152O94986 1710 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 QSER1Q2KHR3 1735 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBR3Q6ZT12 1888 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT-ND4LP03901 98 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC115Q96NT0 180 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMD9Q5K651 1589 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0QY20 66 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACYP1P07311 99 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM244Q5VVB8 128 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC32Q9BV29 185 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRC2Q9UBG0 1479 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINB1P30740 379 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCTE3Q8IZS6 198 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MNS1Q8NEH6 495 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC42Q96M95 316 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3C2BO00750 1634 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GUL6 1792 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPM2O94777 84 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPA17Q15506 151 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13C6PQ8NH95 151 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL11Q969Q4 196 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERP1Q9Y6X1 66 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R129 80 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCS1P62166 190 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 REEP5Q00765 189 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD52Q0P140 79 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 THEM6Q8WUY1 208 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH3P11055 1940 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf77A4D0Y5 90 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHLPP1O60346 1717 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLH3Q9UHC1 1453 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHPRHQ149N8 1683 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BUA1 57 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC2P0DI81 140 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-4.1□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms