RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 C22orf24Q9Y442 160 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 MUC2Q02817 5179 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 ERG28Q9UKR5 140 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 ZNF861PO60384 105 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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PRAME-204ENST00000403441 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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PRAME-204ENST00000403441 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN13O95857 204 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 VPREB1P12018 145 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 PFN2P35080 140 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 LINC00167Q96N53 147 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 DPM2O94777 84 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 FABP4P15090 132 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 Q8NDZ9 215 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 HERV-K104P63124 156 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 A6NJY4 79 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 H0Y8G0 127 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 LEPROTO15243 131 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 IGKCP01834 107 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 CRYGAP11844 174 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 BCE1O60756 84 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-204ENST00000403441 A0A087X002 238 aa7.27□□□□□ -1.25
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PRAME-204ENST00000403441 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.27□□□□□ -1.25
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PRAME-204ENST00000403441 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.26□□□□□ -1.25
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PRAME-204ENST00000403441 J3QQQ9 107 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 SMIM13P0DJ93 91 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 S100A1P23297 94 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 NMUP48645 174 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 E9PLD3 99 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 LINC00158P58513 81 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 PET117Q6UWS5 81 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 GAGE10A6NGK3 116 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 HERVK_113P61574 105 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1G1O75348 118 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 C3orf79P0CE67 100 aa7.23□□□□□ -1.25
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PRAME-204ENST00000403441 IGKV2D-28P01615 120 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 UBE2AP49459 152 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 LCE2CQ5TA81 110 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 TMEM126AQ9H061 195 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 M0R378 163 aa7.21□□□□□ -1.26
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PRAME-204ENST00000403441 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 A0A0J9YXY3 114 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 TMEM238C9JI98 176 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 SPRR1AP35321 89 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 CDIP1Q9H305 208 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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PRAME-204ENST00000403441 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRAME-204ENST00000403441 NDUFC2O95298 119 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 TPRXLQ17RH7 258 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 DAND5Q8N907 189 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 TIMM17BO60830 172 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 KRTDAPP60985 99 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 NCR3O14931 201 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 CTAG1AP78358 180 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 PRLHP81277 87 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-204ENST00000403441 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
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