RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPR1 153 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 CD164Q04900 197 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C7orf33Q8WU49 177 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 ERC2-IT1O76042 136 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 PCNTO95613 3336 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZTC4 211 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 Q8NBF4 154 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C8orf87E5RJ46 101 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 WIPF1O43516 503 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C22orf24Q9Y442 160 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 M0R2N4 97 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 INAFM1C9JVW0 142 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 H3BPC8 53 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GW54 56 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 X6R8D5 127 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 ACYP2P14621 99 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 LINC00167Q96N53 147 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 JMJD1CQ15652 2540 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 K7EQZ3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 LY6G6DO95868 133 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 COA5Q86WW8 74 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 IGKV2-30P06310 120 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 MDFIQ99750 246 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZRX8 168 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 IGLV6-57P01721 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-202ENST00000402738 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 F8P00451 2351 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 Q5XG85 94 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 PRR15Q8IV56 129 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-9P60411 292 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 LCA10Q71F78 164 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 LINC01600Q96MT4 127 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-202ENST00000402738 MOBPQ13875 183 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 MTORP42345 2549 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 KLK9Q2XQG4 91 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZRP5 223 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 A8MWP4 228 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 SMR3AQ99954 134 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 C16orf95Q9H693 158 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 LRRK2Q5S007 2527 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 UQCR11O14957 56 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 EPM2AB3EWF7 344 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 FAM168BA1KXE4 195 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 CEP350Q5VT06 3117 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JQZ4 141 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PNN7 141 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 Q8N377 158 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 PIEZO1Q92508 2521 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-202ENST00000402738 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 ZNF575Q86XF7 245 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 Q1T7F1 81 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 POLQO75417 2590 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 IGFL1Q6UW32 110 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 OCR1Q9BZK8 76 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 LY6G6CO95867 125 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 OXTP01178 125 aa6.48□□□□□ -1.37
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