RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 GHRHP01286 108 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-11P60412 298 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 Q6JHZ5 121 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 Q8N3U1 123 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 IGLV6-57P01721 117 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 CCKP06307 115 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 LINC00575Q6W349 94 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 ANK2Q01484 3957 aa8.77□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 C6orf99Q4VX62 202 aa8.77□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
PRAME-203ENST00000402697 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 C10orf25Q5T742 122 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 C2orf48Q96LS8 159 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 hADV29S1A0JD25 119 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 NCR3O14931 201 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 NOTCH1P46531 2555 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 SLPIP03973 132 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 PDE6GP18545 87 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 C6orf223Q8N319 242 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 LINC00846Q9NV44 126 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 ATOX1O00244 68 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 RETNQ9HD89 108 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 B5MCH6 92 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 CCDC179H3BU77 68 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 Q8NDZ9 215 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 DIRC1Q969H9 104 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 TENM3Q9P273 2699 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-203ENST00000402697 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 UQCRQO14949 82 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 M0R378 163 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZTC4 211 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 UBL5Q9BZL1 73 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 VPREB1P12018 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 COX7BP24311 80 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 ESRGQ1W209 222 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 C15orf56Q8N910 161 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 COX7CP15954 63 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZQT0 140 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-203ENST00000402697 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 DSCR8Q96T75 97 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZRU5 148 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZQY7 126 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 SYCNQ0VAF6 134 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 BCE1O60756 84 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 CRYGAP11844 174 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 RMI2Q96E14 147 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 SERP2Q8N6R1 65 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-203ENST00000402697 MDFIQ99750 246 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 USP17L23D6RBM5 183 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 K7EIL1 84 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 CXCL6P80162 114 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZRP5 223 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92 ms