RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 SEC11CQ9BY50 192 aa7.43□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 TOMM6Q96B49 74 aa7.42□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 K7EMI3 77 aa7.41□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP5LO75964 103 aa7.41□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 S100PP25815 95 aa7.4□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CHCHD2-201ENST00000395422 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 ERASQ7Z444 233 aa7.39□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.39□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 CST9LQ9H4G1 147 aa7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 ERG28Q9UKR5 140 aa7.38□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 PCOTHQ58A44 107 aa7.37□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 RHEBQ15382 184 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC00483Q53H64 154 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.36□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 MOBPQ13875 183 aa7.35□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 NDUFA5Q16718 116 aa7.35□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.35□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC25A20O43772 301 aa7.34□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 G0S2P27469 103 aa7.34□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.34□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 COX17Q14061 63 aa7.33□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 COX19Q49B96 90 aa7.33□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SSPOA2VEC9 5147 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 H3BRM9 83 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 LCE2BO14633 110 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 APOC3P02656 99 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SPRR1AP35321 89 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 PMVKQ15126 192 aa7.32□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SNAPINO95295 136 aa7.31□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SVBPQ8N300 66 aa7.31□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 USH2AO75445 5202 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 M0R2T5 61 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 PRYO14603 147 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 ERC2-IT1O76042 136 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.3□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLC3P0DOY3 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC01546A6NGU7 62 aa7.28□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.28□□□□□ -1.24
CHCHD2-201ENST00000395422 A0A0U1RRA0 63 aa7.27□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.27□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 C9orf92A6NGG3 77 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 NCR3O14931 201 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC00158P58513 81 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 FA2HQ7L5A8 372 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.26□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC01549A6NIU2 74 aa7.24□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 B5MCH6 92 aa7.24□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.23□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 Q9BRP9 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 NDUFA6P56556 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CHCHD2-201ENST00000395422 A0A096LNJ9 63 aa7.21□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 C11orf86A6NJI1 115 aa7.21□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.21□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 SFTA2Q6UW10 78 aa7.21□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 SMIM13P0DJ93 91 aa7.2□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.2□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC00614P0C842 121 aa7.19□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.19□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.19□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.18□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.18□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 HBDP02042 147 aa7.17□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 YPEL4Q96NS1 127 aa7.17□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 Q6ZRX8 168 aa7.16□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLV6-57P01721 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 PMCHL1Q16048 86 aa7.15□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.15□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.15□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.15□□□□□ -1.26
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP6V1G1O75348 118 aa7.14□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.14□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 BAGE3Q86Y29 109 aa7.14□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM223A0PJW6 202 aa7.13□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 DDTP30046 118 aa7.13□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 LIMD2Q9BT23 127 aa7.12□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CHCHD2-201ENST00000395422 S100A12P80511 92 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms