RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 Q9UF83 564 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 USP24Q9UPU5 2620 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PCOTHQ58A44 107 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0087Q14695 138 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 KLK9Q2XQG4 91 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00167Q96N53 147 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 MDFIQ99750 246 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRBP23467 1997 aa13.96□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 LIMD2Q9BT23 127 aa13.95□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 CDIP1Q9H305 208 aa13.95□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.94□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 MGAM2Q2M2H8 2515 aa13.92□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 hDV103S1A0JD37 113 aa13.91□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.91□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa13.9□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 COL4A2P08572 1712 aa13.9□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 RETNLBQ9BQ08 111 aa13.9□□□□□ -0.18
CCSAP-203ENST00000366687 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GW54 56 aa13.88□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 Q8NAQ8 132 aa13.87□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.86□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf195Q5TG92 126 aa13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf64Q8NEQ6 169 aa13.84□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 PRO0461Q9UI25 63 aa13.84□□□□□ -0.19
CCSAP-203ENST00000366687 SPINK1P00995 79 aa13.83□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 PMAIP1Q13794 54 aa13.81□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZRX8 168 aa13.81□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 MOBPQ13875 183 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 BCE1O60756 84 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM29Q86T20 159 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 PSPHP1O15172 72 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 Q8NBF4 154 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-203ENST00000366687 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2-30P06310 120 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZQT0 140 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf90A8MZG2 172 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 MAST4O15021 2626 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 ATRQ13535 2644 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 CRYGAP11844 174 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-203ENST00000366687 LITAFQ99732 161 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 EPM2AB3EWF7 344 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 RTL8CO15255 209 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZRP5 223 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 VPREB1P12018 145 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK5Q92824 1860 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV6-57P01721 117 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 H3BPC8 53 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 CHTF8P0CG12 524 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 ACYP2P14621 99 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf65Q6ZTY9 151 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV22A0A0B4J277 110 aa13.58□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.58□□□□□ -0.23
CCSAP-203ENST00000366687 A0A096LNT2 108 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 FAM229AH3BQW9 127 aa13.55□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00313P59037 77 aa13.54□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.54□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GU69 56 aa13.54□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 PRR34Q9NV39 138 aa13.53□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 BPTFQ12830 3046 aa13.53□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ1DNQ9H478 68 aa13.52□□□□□ -0.24
CCSAP-203ENST00000366687 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.52□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 RPS28P62857 69 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 FAM168BA1KXE4 195 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 K7EIL1 84 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 A8MWP4 228 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 PRO0628Q9UI54 55 aa13.43□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-11P60412 298 aa13.43□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG11AQ6PDA7 123 aa13.43□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf87E5RJ46 101 aa13.42□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 C15orf56Q8N910 161 aa13.41□□□□□ -0.26
CCSAP-203ENST00000366687 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 K7EQZ3 153 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms