RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HCG22E2RYF7 251 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMIM29Q86T20 159 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 C2orf48Q96LS8 159 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA0087Q14695 138 aa9.47□□□□□ -0.89
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LY6G6CO95867 125 aa9.45□□□□□ -0.9
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C22orf24Q9Y442 160 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAPPC10-201ENST00000291574 hDV103S1A0JD37 113 aa9.41□□□□□ -0.9
TRAPPC10-201ENST00000291574 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.4□□□□□ -0.9
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C16orf95Q9H693 158 aa9.4□□□□□ -0.9
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TRAPPC10-201ENST00000291574 FHL3Q13643 280 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZQT0 140 aa9.38□□□□□ -0.91
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00167Q96N53 147 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC10-201ENST00000291574 X6R8D5 127 aa9.36□□□□□ -0.91
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LIMD2Q9BT23 127 aa9.33□□□□□ -0.92
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TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.31□□□□□ -0.92
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8NBF4 154 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.28□□□□□ -0.92
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TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV2-30P06310 120 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 HTTP42858 3142 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC10-201ENST00000291574 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.28□□□□□ -0.92
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPREB1P12018 145 aa9.18□□□□□ -0.94
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C5orf42Q9H799 3197 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 A8MUN3 132 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAST4O15021 2626 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACYP2P14621 99 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPM2AB3EWF7 344 aa9.15□□□□□ -0.94
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8NAQ8 132 aa9.15□□□□□ -0.94
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CFAP54Q96N23 3096 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.14□□□□□ -0.95
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CHTF8P0CG12 524 aa9.13□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.13□□□□□ -0.95
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.11□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 CENPEQ02224 2701 aa9.11□□□□□ -0.95
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TRAPPC10-201ENST00000291574 KLKP1Q107X0 134 aa9.1□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.09□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.09□□□□□ -0.95
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL4A2P08572 1712 aa9.08□□□□□ -0.96
TRAPPC10-201ENST00000291574 BRCA2P51587 3418 aa9.08□□□□□ -0.96
TRAPPC10-201ENST00000291574 H7BZZ5 65 aa9.08□□□□□ -0.96
TRAPPC10-201ENST00000291574 C16orf90A8MZG2 172 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERC2-IT1O76042 136 aa9.07□□□□□ -0.96
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