RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 HIST1H4GQ99525 98 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GWB2 263 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 TMEM238C9JI98 176 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 APOMO95445 188 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 MALP21145 153 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZVH6 145 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 LINC01600Q96MT4 127 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 CXCL5P42830 114 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 BATFQ16520 125 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C15orf56Q8N910 161 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 RMI2Q96E14 147 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A0A0U1RQV1 116 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 PRSS2P07478 247 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SPAG11BQ08648 103 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C2orf82Q6UX34 121 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SMIM13P0DJ93 91 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 IFITM1P13164 125 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 TAX1BP3O14907 124 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C14orf177Q52M58 125 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C10orf25Q5T742 122 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 ERG28Q9UKR5 140 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A6NDN8 102 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 F8WDY8 70 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CKS1BP61024 79 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 COX17Q14061 63 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFAP161Q6P656 301 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C2orf48Q96LS8 159 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A4D1N5 150 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 PANO1I0J062 215 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFC1BP0CG36 223 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFC1P0CG37 223 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A6NJY4 79 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP10-8P60410 259 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.83□□□□□ -1.32
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APOC3-201ENST00000227667 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A0B4J2C4 111 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A0U1RRA0 63 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 K7ERJ3 54 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 USP17L23D6RBM5 183 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SLPIP03973 132 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 PFN2P35080 140 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 LINC00158P58513 81 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GV90 55 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf118A6NHY6 69 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 NPC2P61916 151 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 COPS9Q8WXC6 57 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RNF151Q2KHN1 245 aa6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SYCNQ0VAF6 134 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RAB37Q96AX2 223 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2D-28P01615 120 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 REG3GQ6UW15 175 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 C7orf33Q8WU49 177 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 A0A087WYN8 130 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NDUFC2O95298 119 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 TSPAN13O95857 204 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 Q8NDZ9 215 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 H3BUT2 72 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CARD19Q96LW7 228 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 A0A1W2PPM0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZRP5 223 aa6.74□□□□□ -1.33
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