RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.23□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.23□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 USP24Q9UPU5 2620 aa8.23□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 SORL1Q92673 2214 aa8.23□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF843Q8N446 348 aa8.22□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 LINC01560Q8TB33 94 aa8.22□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 SYCNQ0VAF6 134 aa8.21□□□□□ -1.09
SPIN3-241ENST00000640511 K7EQD1 137 aa8.21□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-53P01767 116 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 PDE6GP18545 87 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 A0A096LNT2 108 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 RELNP78509 3460 aa8.19□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 A8MUN3 132 aa8.19□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3-11P01762 117 aa8.19□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.19□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 LYRM9A8MSI8 78 aa8.18□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 OCR1Q9BZK8 76 aa8.18□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 C8orf87E5RJ46 101 aa8.17□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 NDUFS5O43920 106 aa8.17□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.17□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.17□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.16□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.16□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.16□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.15□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.15□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.15□□□□□ -1.1
SPIN3-241ENST00000640511 K7EMT4 169 aa8.15□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 USMG5Q96IX5 58 aa8.15□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 AKAP6Q13023 2319 aa8.14□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 C16orf90A8MZG2 172 aa8.14□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 PRM2P04554 102 aa8.13□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2AP49459 152 aa8.13□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 C6orf99Q4VX62 202 aa8.13□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 Q5VV11 94 aa8.13□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00575Q6W349 94 aa8.13□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2L6O14933 153 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 MUC7Q8TAX7 377 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 LRBAP50851 2863 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 LY6HO94772 140 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.12□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.11□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 C19orf84I3L1E1 186 aa8.11□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 Q8N9L7 120 aa8.11□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.11□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.1□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 PSCAO43653 123 aa8.1□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.09□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 FLNCQ14315 2725 aa8.09□□□□□ -1.11
SPIN3-241ENST00000640511 A6NN06 94 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 HCG22E2RYF7 251 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 H3BQ85 93 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV4-1P06312 121 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 LINC01006Q8NI28 216 aa8.08□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 H3BUA1 57 aa8.07□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 ESM1Q9NQ30 184 aa8.07□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 Q6ZQY7 126 aa8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 LRRK2Q5S007 2527 aa8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 PRR4Q16378 134 aa8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.06□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 COL12A1Q99715 3063 aa8.05□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.05□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 DIRC1Q969H9 104 aa8.05□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.04□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 LCA10Q71F78 164 aa8.04□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 CHD6Q8TD26 2715 aa8.04□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.04□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 SPG11Q96JI7 2443 aa8.04□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 A8MTW9 85 aa8.03□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.03□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.03□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.03□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 CELA1Q9UNI1 258 aa8.03□□□□□ -1.12
SPIN3-241ENST00000640511 LMO4P61968 165 aa8.01□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 LCE6AA0A183 80 aa8□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 COX7BP24311 80 aa8□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 PRR15LQ9BU68 103 aa8□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 CENPEQ02224 2701 aa8□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.99□□□□□ -1.13
SPIN3-241ENST00000640511 SMIM29Q86T20 159 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms