RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPN13Q12923 2485 aa-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 MT-ATP8P03928 68 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SPRR2DP22532 72 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 S100PP25815 95 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 CUX1P39880 1505 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM218A2RU14 115 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 C5P01031 1676 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 LRP2P98164 4655 aa-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A1B0GU69 56 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 CRIPTQ9P021 101 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 SLIT1O75093 1534 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 AKAP12Q02952 1782 aa-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 H7BZZ5 65 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 MPC2O95563 127 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 RBP2P50120 134 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 ATRQ13535 2644 aa-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.43
SPTAN1-232ENST00000636483 H0Y9P7 68 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BQF6 201 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 UQCRHP07919 91 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 PMCHL1Q16048 86 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.16□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 MUC2Q02817 5179 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ATOX1O00244 68 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFC1O43677 76 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 GNGT1P63211 74 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 USMG5Q96IX5 58 aa-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 COX8AP10176 69 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 TRGV9Q99603 122 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.18□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 SPINK4O60575 86 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.19□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCC2Q92887 1545 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 COL6A3P12111 3177 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.2□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ZANQ9Y493 2812 aa-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms