RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626416.2

STXBP1-208, Transcript of syntaxin binding protein 1, human

TSL 5

Gene STXBP1, Length 3,700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP1-208	ENST00000626416	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A0U1RQV1	116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	CD164	Q04900	197 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A087WW49	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A0B4J2C4	111 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	LST1	O00453	97 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STXBP1-208	ENST00000626416	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	VCY	O14598	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SLPI	P03973	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		K7EIL1	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TRAC	P01848	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	ATP5G1	P05496	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LEPROT	O15243	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LY6G6C	O95867	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	PFN2	P35080	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	COX6C	P09669	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		H3BT86	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	NCR3	O14931	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	COX6A2	Q02221	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SLURP1	P55000	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A0J9YX75	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A087WYN8	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SS18	Q15532	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		Q6ZSN1	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		M0QY20	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	MIA	Q16674	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	TMEM258	P61165	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416		Q9H8V8	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STXBP1-208	ENST00000626416	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416		A0A0A0MQY5	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STXBP1-208	ENST00000626416	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms