RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622457.1

LTBP4-238, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-238	ENST00000622457	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457		A0A0J9YXV3	536 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LTBP4-238	ENST00000622457	PRSS2	P07478	247 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	CXCL5	P42830	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	TNXB	P22105	4242 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	ATP5L	O75964	103 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457		Q6ZRP5	223 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457		F8VRH5	84 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	CKS1B	P61024	79 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457		A0A1W2PNN7	141 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457		H3BRM9	83 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	OXT	P01178	125 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	PMCHL1	Q16048	86 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	TRGC2	P03986	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	ODF1	Q14990	250 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LTBP4-238	ENST00000622457	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	COLCA2	A8K830	154 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	HSBP1	O75506	76 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	NDUFA6	P56556	154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	LINC00310	P59036	64 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457		M0QXV9	152 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	SERF1A	O75920	110 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	MT1HL1	P0DM35	61 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LTBP4-238	ENST00000622457	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	LEPROTL1	O95214	131 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	COX17	Q14061	63 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	SCO1	O75880	301 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	PLN	P26678	52 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	UBE2B	P63146	152 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	LINC01600	Q96MT4	127 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LTBP4-238	ENST00000622457	NUPR1	O60356	82 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BK	O60814	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BO	P23527	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BB	P33778	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BD	P58876	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BC	P62807	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457		H0Y8G0	127 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	PFN2	P35080	140 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LTBP4-238	ENST00000622457	FABP4	P15090	132 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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