RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 TIMM17BO60830 172 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 NREPQ16612 68 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 TIRAPP58753 221 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 TSHBP01222 138 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 LINC01546A6NGU7 62 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 GYPEP15421 78 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 Q6JHZ5 121 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 HIVEP1P15822 2718 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 XCL1P47992 114 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 MP68P56378 58 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 Q6ZSN1 163 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 C9orf85Q96MD7 179 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 IGIPA6NJ69 53 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-222ENST00000621217 APOC4P55056 127 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 PRO0461Q9UI25 63 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 PRO0628Q9UI54 55 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 K7EQD1 137 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 NCR3O14931 201 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 DPH3Q96FX2 82 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 SNURFQ9Y675 71 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 A0A096LNT2 108 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 LINC00315P59091 139 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 ZNF575Q86XF7 245 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 ODF3Q96PU9 254 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 NDUFA1O15239 70 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 CDK2AP2O75956 126 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 C16orf74Q96GX8 76 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 SEC61GP60059 68 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 SLPIP03973 132 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 CR1P17927 2039 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 A0A087WVE0 104 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 CRYGAP11844 174 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 BPY2O14599 106 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-222ENST00000621217 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 RETNQ9HD89 108 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 BRI3O95415 125 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 IGLV1-51P01701 117 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 FSHBP01225 129 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 LYRM9A8MSI8 78 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 MIFP14174 115 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 COX6A2Q02221 97 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 KLK9Q2XQG4 91 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 SCXQ7RTU7 201 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 DIRC1Q969H9 104 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 KLK12Q9UKR0 248 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 TENM4Q6N022 2769 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 C4orf26Q17RF5 130 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 BSNQ9UPA5 3926 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 PMAIP1Q13794 54 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 PRO0255Q9UI72 69 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 CCKP06307 115 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-222ENST00000621217 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.47□□□□□ -1.37
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