RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 K7EMT4 169 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 GAS8-AS1O95177 125 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 MALP21145 153 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 SFTA2Q6UW10 78 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 PRO0628Q9UI54 55 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 HTN3P15516 51 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 LINC00315P59091 139 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 Q9H8V8 135 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 M0R3E3 92 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA4O00483 81 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 TRIAP1O43715 76 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 Q1RN00 199 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 FAM222AQ5U5X8 452 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 LINC00528Q8N1L1 170 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 DCANP1Q8TF63 244 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 CCL18P55774 89 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 ZNF876PQ49A33 203 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 Q5XG85 94 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 SERP2Q8N6R1 65 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 A0A0J9YXY3 114 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGIPA6NJ69 53 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 TIMM17BO60830 172 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 NDUFC2O95298 119 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-48P01763 117 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 MT1HL1P0DM35 61 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 LELP1Q5T871 98 aa7.97□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 UPK3BQ9BT76 320 aa7.97□□□□□ -1.13
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WTM6 91 aa7.96□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.96□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 KNCNA6PVL3 124 aa7.96□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 K7EIM0 57 aa7.96□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.96□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 BCE1O60756 84 aa7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 ZNF415Q09FC8 603 aa7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.95□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 Q6JHZ5 121 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 COPS9Q8WXC6 57 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 JPT2Q9H910 190 aa7.94□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 hADV29S1A0JD25 119 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 VCYO14598 125 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TSHBP01222 138 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 RHOHQ15669 191 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.93□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.92□□□□□ -1.14
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HCG18-241ENST00000602290 NXPH4O95158 308 aa7.92□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 XCL2Q9UBD3 114 aa7.92□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 K7EQG2 157 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 DAD1P61803 113 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZSA8 131 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 Q8TAT8 98 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.91□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 COX7A2LO14548 114 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 MIAQ16674 131 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 C4orf26Q17RF5 130 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 LITAFQ99732 161 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.9□□□□□ -1.14
HCG18-241ENST00000602290 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 I3L3M4 83 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 H7C2G1 150 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 C9orf85Q96MD7 179 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 RS1O15537 224 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-241ENST00000602290 CTSGP08311 255 aa7.87□□□□□ -1.15
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