RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM13P0DJ93 91 aa15.27■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 F8WDY8 70 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 SPAG11BQ08648 103 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC32Q5I0X7 151 aa15.25■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC7Q8TAX7 377 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 COX17Q14061 63 aa15.22■□□□□ 0.03
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CAPNS1-212ENST00000591041 LITAFQ99732 161 aa15.18■□□□□ 0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 ERG28Q9UKR5 140 aa15.18■□□□□ 0.02
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CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf48Q96LS8 159 aa15.16■□□□□ 0.02
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CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0B4J2C4 111 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.12■□□□□ 0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 A4D1N5 150 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PFN2P35080 140 aa15.11■□□□□ 0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf118A6NHY6 69 aa15.1■□□□□ 0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf82Q6UX34 121 aa15.09■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.09■□□□□ 0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf84H3BNL1 204 aa15.08■□□□□ 0
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf177Q52M58 125 aa15.08■□□□□ 0
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CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf56Q8N910 161 aa15.04■□□□□ -0
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CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L23D6RBM5 183 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BUT2 72 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 Q1RN00 199 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf223Q8N319 242 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.01□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PKIGQ9Y2B9 76 aa15□□□□□ -0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPM0 123 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD19Q96LW7 228 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFC2O95298 119 aa14.97□□□□□ -0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 CASC10Q5T4H9 136 aa14.97□□□□□ -0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.96□□□□□ -0.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZRU5 148 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.93□□□□□ -0.02
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CAPNS1-212ENST00000591041 RYR2Q92736 4967 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE10A6NGK3 116 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.92□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C2G1 150 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.89□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE6AA0A183 80 aa14.87□□□□□ -0.03
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