RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XCL1P47992 114 aa11.37□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C2orf82Q6UX34 121 aa11.37□□□□□ -0.59
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.11□□□□□ -0.63
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.08□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.07□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.07□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ESRGQ1W209 222 aa11.06□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC32Q5I0X7 151 aa11.06□□□□□ -0.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCR3O14931 201 aa11.05□□□□□ -0.64
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