RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 INE1O15225 51 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 IGKV4-1P06312 121 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 COA5Q86WW8 74 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 Q96NJ1 140 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.84□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.84□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ABCC6O95255 1503 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ZNF831Q5JPB2 1677 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 NUP188Q5SRE5 1749 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 UBR3Q6ZT12 1888 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa2.83□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TSC2P49815 1807 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 J3QRE1 110 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 COX17Q14061 63 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 NREPQ16612 68 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 LCE1CQ5T751 118 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TOMM5Q8N4H5 51 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ABCA4P78363 2273 aa2.82□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ANKRD36A6QL64 1941 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP10-1P60331 282 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 NHSL1Q5SYE7 1610 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TET1Q8NFU7 2136 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 BRWD1Q9NSI6 2320 aa2.81□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 C5P01031 1676 aa2.8□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 NDUFB1O75438 58 aa2.8□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ACYP2P14621 99 aa2.8□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.8□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 M0R2N4 97 aa2.79□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 WFDC9Q8NEX5 89 aa2.79□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.79□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 RICTORQ6R327 1708 aa2.79□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa2.78□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.78□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 FCER1GP30273 86 aa2.78□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
TSG101-211ENST00000580814 ZFHX3Q15911 3703 aa2.78□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 EFCAB6Q5THR3 1501 aa2.78□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 PRH1P02810 166 aa2.77□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 BCORQ6W2J9 1755 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 CAV3P56539 151 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 CCL19Q99731 98 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.75□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 DNAJC13O75165 2243 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 SAMD9Q5K651 1589 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 FMN2Q9NZ56 1722 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 ENHOQ6UWT2 76 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 Q6ZQY7 126 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 GAFA1Q96PS6 74 aa2.74□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 MYO7AQ13402 2215 aa2.73□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.73□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 K7EMI3 77 aa2.72□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 NMES1Q9C002 83 aa2.72□□□□□ -1.97
TSG101-211ENST00000580814 NRAPQ86VF7 1730 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 LCE6AA0A183 80 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 UBL5Q9BZL1 73 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 AGLP35573 1532 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 TJP1Q07157 1748 aa2.71□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 IQGAP2Q13576 1575 aa2.7□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 SLIT1O75093 1534 aa2.7□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 A0A1B0GU69 56 aa2.7□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 CMC2Q9NRP2 79 aa2.7□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 C3P01024 1663 aa2.69□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 ADCY10Q96PN6 1610 aa2.69□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.69□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.69□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.69□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa2.68□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.67□□□□□ -1.98
TSG101-211ENST00000580814 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms