RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.21■□□□□ 0.03
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PTPRM-211ENST00000580170 BRI3O95415 125 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRM-211ENST00000580170 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRM-211ENST00000580170 PCOTHQ58A44 107 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRM-211ENST00000580170 ACACBO00763 2458 aa15.19■□□□□ 0.02
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PTPRM-211ENST00000580170 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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PTPRM-211ENST00000580170 C8orf87E5RJ46 101 aa14.72□□□□□ -0.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ACYP2P14621 99 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZQT0 140 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.66□□□□□ -0.06
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