RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 H3BRM9 83 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 ATP5LO75964 103 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 Q6ZRP5 223 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 YPEL4Q96NS1 127 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-204ENST00000578208 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 PMCHL1Q16048 86 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 MYCBP2O75592 4640 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 A0A096LNJ9 63 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 F8VRH5 84 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 COX7B2Q8TF08 81 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 SPINK8P0C7L1 97 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 IGLC3P0DOY3 106 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 HSBP1O75506 76 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 BAGE3Q86Y29 109 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 FAM168BA1KXE4 195 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 M0QXV9 152 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 TRGC2P03986 189 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-204ENST00000578208 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 UBE2BP63146 152 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 C1orf137Q5JT78 98 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 REG3GQ6UW15 175 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 C11orf86A6NJI1 115 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 SFTA2Q6UW10 78 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 SERF1AO75920 110 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 HERC1Q15751 4861 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 COLCA2A8K830 154 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 H0Y8G0 127 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 LEPROTL1O95214 131 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 IGLV7-43P04211 117 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 PFN2P35080 140 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 C22orf24Q9Y442 160 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-204ENST00000578208 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 DIRC1Q969H9 104 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 ERG28Q9UKR5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 TMEM223A0PJW6 202 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 COX17Q14061 63 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 ODF1Q14990 250 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 LINC01600Q96MT4 127 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 NUPR1O60356 82 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 SCO1O75880 301 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 MT1HL1P0DM35 61 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 FABP4P15090 132 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 PLNP26678 52 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 LINC00310P59036 64 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 GAGE10A6NGK3 116 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 H0Y9J4 135 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 ATP6V1G1O75348 118 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 DPM2O94777 84 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 LINC00158P58513 81 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 HERVK_113P61574 105 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 LINC00167Q96N53 147 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-204ENST00000578208 LINC00587B1AMM8 73 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 HERV-K104P63124 156 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 A0A0U1RRA0 63 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H2BKO60814 126 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-204ENST00000578208 IGKCP01834 107 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms