RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZRP5	223 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFA1	O15239	70 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-ND6	P03923	174 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WZ39	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf202	A1L168	122 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479		K7EMI3	77 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	G0S2	P27469	103 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZN92	141 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	VCX2	Q9H322	139 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2D1	P51668	147 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	NPS	P0C0P6	89 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	AMELX	Q99217	191 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS2	P07478	247 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PCP4	P48539	62 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC11A	P67812	179 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CKS1B	P61024	79 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	HERVK_113	P63121	156 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ERAS	Q7Z444	233 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8IZM0	81 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.75	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QXV9	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	SERF1A	O75920	110 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2B	P63146	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479		F8VRH5	84 aa		5.73	□□□□□ -1.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ODF1	Q14990	250 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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