RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-221ENST00000550734 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 HERVK_113P63121 156 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 REG3GQ6UW15 175 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 Q8IZM0 81 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 C2orf82Q6UX34 121 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 SCO1O75880 301 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 FAM168BA1KXE4 195 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 PRSS2P07478 247 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 CKS1BP61024 79 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 GAGE2EQ4V326 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 CST9LQ9H4G1 147 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 CXCL5P42830 114 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-221ENST00000550734 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 F8VRH5 84 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 PMVKQ15126 192 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 C1orf137Q5JT78 98 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 FA2HQ7L5A8 372 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 IGLV7-43P04211 117 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 M0QXV9 152 aa7□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 C18orf32Q8TCD1 76 aa7□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 YPEL4Q96NS1 127 aa7□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 A0A096LNJ9 63 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 LINC00614P0C842 121 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 DIRC1Q969H9 104 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 IGLC3P0DOY3 106 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 COX7B2Q8TF08 81 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 COLCA2A8K830 154 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 H0Y9J4 135 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 H3BRM9 83 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-221ENST00000550734 HBDP02042 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 RAB5BP61020 215 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 C22orf24Q9Y442 160 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 NUPR1O60356 82 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 ATP5LO75964 103 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 SPINK8P0C7L1 97 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 UBE2BP63146 152 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 TRGC2P03986 189 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 ZNF861PO60384 105 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 NDUFA6P56556 154 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 PMCHL1Q16048 86 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 SFTA2Q6UW10 78 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 BAGE3Q86Y29 109 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 COX17Q14061 63 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-221ENST00000550734 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 C11orf86A6NJI1 115 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 BCE1O60756 84 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 LINC00167Q96N53 147 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RQV1 116 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 ERG28Q9UKR5 140 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 TMEM223A0PJW6 202 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BKO60814 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BJP06899 126 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 VPREB1P12018 145 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-221ENST00000550734 HIST1H2BOP23527 126 aa6.85□□□□□ -1.31
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