RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8IZM0 81 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TOMM6Q96B49 74 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01546A6NGU7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 APOC3P02656 99 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SVBPQ8N300 66 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 TIMM17AQ99595 171 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SNAPINO95295 136 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 C22orf24Q9Y442 160 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 HERVK_113P63121 156 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 RHEBQ15382 184 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 ERASQ7Z444 233 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.06□□□□□ -1.28
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.05□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS2P07478 247 aa7.05□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 CKS1BP61024 79 aa7.05□□□□□ -1.28
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CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 F8VRH5 84 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF861PO60384 105 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 G0S2P27469 103 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC11AP67812 179 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.03□□□□□ -1.28
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CLSTN3-211ENST00000541667 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.02□□□□□ -1.29
CLSTN3-211ENST00000541667 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.01□□□□□ -1.29
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.01□□□□□ -1.29
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGLC3P0DOY3 106 aa6.96□□□□□ -1.3
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CLSTN3-211ENST00000541667 TSPAN13O95857 204 aa6.91□□□□□ -1.3
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CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5LO75964 103 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-211ENST00000541667 CRYGAP11844 174 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-211ENST00000541667 PFN2P35080 140 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf86A6NJI1 115 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFA6P56556 154 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 ERG28Q9UKR5 140 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC17Q685J3 4493 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 COLCA2A8K830 154 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2D-28P01615 120 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 HBDP02042 147 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 COX17Q14061 63 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM238C9JI98 176 aa6.87□□□□□ -1.31
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