RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528847.1

RPS3-211, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-211ENST00000528847 PPP1R17O96001 155 aa5.67□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 UBE2AP49459 152 aa5.67□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.67□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 TCAPO15273 167 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 C20orf78Q9BR46 151 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 CKS1BP61024 79 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3-211ENST00000528847 SCO1O75880 301 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 PRSS2P07478 247 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 PRLHP81277 87 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 RIGQ13278 110 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 CFC1BP0CG36 223 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 CKS2P33552 79 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 Q6ZN92 141 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 Q8IZM0 81 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 LINC00862A6NCI5 91 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 NPYP01303 97 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 IGKV2D-28P01615 120 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 CEBPGP53567 150 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 F8VRH5 84 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 TMEM250H0YL14 139 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 LINC01551Q86U37 167 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 DAND5Q8N907 189 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 TMEM141Q96I45 108 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 OSTCQ9NRP0 149 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 V9GYV3 84 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 TMEM238C9JI98 176 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 D6R8Y8 96 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 NDUFA5Q16718 116 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3-211ENST00000528847 RAB5BP61020 215 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 Q8NBF4 154 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 AMELXQ99217 191 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 TMEM126AQ9H061 195 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 RAB5AP20339 215 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 M0R378 163 aa5.56□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SPRR4Q96PI1 79 aa5.56□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 VCX2Q9H322 139 aa5.56□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.55□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 IFITM2Q01629 132 aa5.55□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 PET117Q6UWS5 81 aa5.55□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.55□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SPINK1P00995 79 aa5.54□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 IGIPA6NJ69 53 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 VPREB1P12018 145 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 CXCL5P42830 114 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 HERVK_113P63121 156 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 PCOTHQ58A44 107 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 SLC51BQ86UW2 128 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 Q8N377 158 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.53□□□□□ -1.52
RPS3-211ENST00000528847 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 A0A1B0GW15 77 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 M0R2T5 61 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 PPBPP02775 128 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 RAB14P61106 215 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 Q8NDZ9 215 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 COX7B2Q8TF08 81 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 PRELID3AQ96N28 172 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 SSPOA2VEC9 5147 aa5.51□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 A0A1B0GXF2 115 aa5.51□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 S100A1P23297 94 aa5.51□□□□□ -1.53
RPS3-211ENST00000528847 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 258 ms